Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms