Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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