Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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