Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM2Q13029 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
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