Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK3Q13003 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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