Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STX4Q12846 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms