Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BPTFQ12830 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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