Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RAB40BQ12829 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RAB40BQ12829 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RAB40BQ12829 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RAB40BQ12829 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RAB40BQ12829 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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