Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TROQ12816 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TROQ12816 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TROQ12816 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TROQ12816 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TROQ12816 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TROQ12816 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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