Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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