Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWF1Q12792 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWF1Q12792 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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