Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GOLGA3Q08378 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms