Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms