Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms