Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKCDQ05655 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms