Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms