Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms