Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms