Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms