Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms