Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms