Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELF3P78545 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELF3P78545 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELF3P78545 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELF3P78545 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELF3P78545 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELF3P78545 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELF3P78545 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELF3P78545 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms