Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms