Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVK-24P63145 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVK-24P63145 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVK-24P63145 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVK-24P63145 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVK-24P63145 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVK-24P63145 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVK-24P63145 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-24P63145 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms