Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTA2P62736 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms