Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms