Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERVK_113P61574 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P61574 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms