Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms