Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF3P57682 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF3P57682 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms