Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms