Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms