Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB3P54284 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms