Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms