Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF6P49848 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF6P49848 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF6P49848 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms