Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms