Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCCP43146 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCCP43146 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCCP43146 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCCP43146 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCCP43146 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCCP43146 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCCP43146 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCCP43146 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DCCP43146 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms