Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDF5P43026 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF5P43026 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms