Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKARP32238 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms