Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFNP31947 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SFNP31947 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SFNP31947 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SFNP31947 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms