Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AP003692.1-201ENST00000521706 796 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC005726.6-201ENST00000579019 1083 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC012150.1-201ENST00000553075 593 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC121320.1-201ENST00000580975 839 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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HOXD11P31277 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC126474.1-201ENST00000623555 1293 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC093334.1-201ENST00000559904 423 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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