Protein–RNA interactions for Protein: P30305

CDC25B, M-phase inducer phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25BP30305 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDC25BP30305 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC25BP30305 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC25BP30305 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC25BP30305 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC25BP30305 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms