Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A5P29400 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms