Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5AP29375 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms