Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms