Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRMP28827 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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