Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCAP28676 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCAP28676 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCAP28676 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GCAP28676 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms