Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD1P28340 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD1P28340 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD1P28340 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms