Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXP28300 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXP28300 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms