Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms