Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPREP23469 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPREP23469 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPREP23469 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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